L'elecció de matèries primeres per a fertilitzants orgànics i fertilitzants bio-orgànics poden ser diversos fems de bestiar i residus orgànics.La fórmula bàsica de producció varia amb diferents tipus i matèries primeres;les matèries primeres bàsiques són: fems de pollastre, fems d'ànec, fems d'oca, fems de porc, fems de bestiar i ovella, palla de cultiu, fang de filtre de la indústria del sucre, bagàs, residus de remolatxa sucrera, grans de destil·lador, residus de medicaments, residus de furfural, residus de fongs, fesols. pastís, pastís de llavors de cotó, pastís de colza, carbó d'herba, etc.